Los suelos correspondientes al Distrito de Peyrano se hallan ubicados dentro de la denominada subarea maicera, que integra una región extensa, perfectamente definida por su relieve, denominada Pampa Ondulada. En general son suelos Brunizem ( Argiudales Típicos ), de horizontes superficial franco limoso, con un espesor promedio de 25 cm. medianamente acido, con un subsuelo arcilloso o franco arcilloso.
Desde el punto de vista químico son suelos prácticamente saturados y bien provistos nitrógeno, fósforo, potasio, calcio, magnesio, pudiéndose encontrar en alguna de estas áreas diferencias en nitrógeno.
Especialmente las tierras del distrito corresponden a la llamada serie de Peyrano, que tiene estas características: suelos oscuros y profundos, con una capa arable que llega hasta los 25 y 30 cm., muy oscura y negra. Cuando se hallan los campos en cierta pendiente presentan riesgo de perder su capa superficial por erosión, salvando esta posibilidad presentan muy pocas limitaciones.
La altura a nivel del mar oscila entre los 65 y 80 metros.La cuenca natural, recolecta de las aguas de los campos circundantes es el Arroyo del Medio.

La zona del distrito de Manuel Peyrano se encuentra dentro de los llamados clima  benignos, sin grandes variaciones, condiciones que hacen muy apta la zona para la explotación agrícola-ganadera.
La temperatura media anual es de 16º C y mínima de 9,5 C. La precipitación media anual es de 946mm., llegando en los periodos más húmedos a 1297mm.Los meses más secos se encuentran en invierno (junio, julio, agosto) y los meses más lluviosos son enero y marzo. El número medio de días con heladas es de 24,5, siendo la fecha media de la primera helada el 21 de mayo y de la última helada el 9 de septiembre.
El agua en el distrito resulta potable en toda la zona encontrándose las primeras napas a una profundidad de 8 a 10 metros.
El aspecto físico que presenta es el de una llanura con suaves ondulaciones y algunas depresiones motivadas por la existencia de pequeñas lagunas y cañadas.
No existen en toda su extensión bosques naturales.

En toda la zona sur de la provincia de Santa Fe existió en gran cantidad el ciervo y el venado, que fueron el alimento principal de los aborígenes que rondaban la zona.
Estos animales sufrirán una persecución salvaje, comenzando a desaparecer por completo a partir de 1880. Otros animales característicos eran las vizcachas, un roedor que realizaba grandes cuevas. Existieron también grandes cantidades de avestruces(ñandú). La cría de estos animales trajo como consecuencia el primer alambrado que se instaló en los campos de Rueda.
Las comadrejas fueron una verdadera plaga, así como también las ratas y ratones.La falta de árboles hacían que fueran muy pocas las aves en la zona, salvo algunas garzas y teros que se encontraban.